CEU DESCUBRE. The human microbiome in health and oral diseases

Esperamos tu participación. La actividad se realizará el Miércoles 18 de febrero de 2015

Lugar: Edificio Luis Campos Górriz (Universidad Cardenal Herrera, Alfara del Patriarca, Valencia, España)
Fecha inicio: miércoles, 18 de febrero de 2015 a las 14:00 h.
Fecha fin: miércoles, 18 de febrero de 2015 a las 15:00 h.


Conferencia a cargo del 

Dr. Alex Mira

, director del laboratorio de Microbioma Humano en el Área Genómica y Salud de la Fundación FISABIO.

Microbioma y diagnóstico de enfermedades:

El Dr. Mira hablará de técnicas de secuenciación masiva para identificar posibles microorganismos asociados a la caries dental. El Dr. Mira demostrará que las bacterias presentes en la saliva no son buenos marcadores de esta patología. Sin embargo, se han identificado una serie de metabolitos que cuando se miden en este fluido, nos indican con gran precisión si la persona tiene caries. Este descubrimiento ha sido patentado como test de diagnóstico del riesgo de caries, y al indicar la causa del riesgo, permitirá dar un tratamiento preventivo personalizado a cada paciente.

Formación de biopelículas en tiempo real:

El grupo del Dr. Mira ha desarrollado un nuevo modelo de biofilm in vitro donde se puede monitorizar el crecimiento de biopelículas monoespecíficas y complejas (como la placa dental) en tiempo real. Este modelo de biofilm está siendo utilizado para identificar moléculas inhibidoras del Quórum Sensing y para medir el crecimiento de las bacterias que causan infecciones en catéteres e implantes médicos en tiempo real, identificando no sólo las dosis inhibitorias necesarias sino también que algunos antibióticos de hecho estimulan la producción de más biofilm. Todo ello supondrá un enorme ahorro económico en el sistema de salud, pues se podría ver la resistencia a antibióticos de las bacterias causantes de infecciones post-operatorias y decidir un tratamiento efectivo en la mitad de tiempo que en la actualidad.

Nuevas estrategias contra las enfermedades orales:

Este equipo ha obtenido el primer metagenoma a nivel mundial de la placa dental humana en voluntarios sanos y con distintos grados de afectación por caries, lo que nos valió el Premio Biomedal 2012. Posteriormente el primer metatranscriptoma de la placa dental humana y el primer metaproteoma. Estas investigaciones tratan de aplicar los conocimientos de la microbiota oral para combatir la caries dental, habiendo descubierto una nueva especie bacteriana de la cavidad oral, bautizada como Streptococcus dentisani que produce bacteriocinas que aniquilan a lasbacterias causantes de la caries. Este trabajo ha dado lugar a una patente que protege el uso de esta bacteria como probiótico anticaries en todo el mundo. Además, se ha determinado la diversidad bacteriana en distintos micronichos de la boca, propuesto la etiología de la enfermedad en base al RNA y desarrollado una nueva hipótesis sobre la formación y avance de la caries dental, basada en el metagenoma de las lesiones de caries

Genómica bacteriana:

El trabajo más tradicional del grupo estaba centrado en la genómica comparada y evolutiva microbiana y, aunque ya no es la principal línea de investigación, ellos seguían realizando trabajos en este campo. Por ejemplo, en el concepto del pan-genoma bacteriano, en la identificación de islas de patogénesis mediante reclutamiento metagenómico o en un nuevo método para la caracterización de orígenes de replicación en procariotas. Mediante esta aproximación, basada en la secuenciación masiva, se han identificado cuatro orígenes de replicación en la arquea Pyrobaculum.

Destinatarios


Estudiantes y profesores de Odontología y de Ciencias de la Salud

Ponente


El Dr. Alex Mira dirige el laboratorio para el Estudio del Microbioma Humano y se creó en el año 2009, al integrarse en el Área de Genómica y Salud de la Fundación FISABIO. La investigación del grupo se centra en caracterizar la microbiota humana comensal y patógena desde una aproximación mixta de bioinformática y trabajo experimental en genómica y meta-genómica. Se trata de un equipo multidisciplinar que incluye microbiólogos, biólogos moleculares, dentistas, farmacéuticos y bioinformáticos. El Dr. Mira ha sido uno de los fundadores de la Red Nacional de Genómica Bacteriana. Su contribución científica a este campo le valió en el año 2009 el Premio Jaime Ferrán de la Sociedad Española de Microbiología.

Formación Académica

2009-present: Senior Researcher, Department of Genomics and Health, Center for Public Health Research (CSISP), Valencia, Spain

2004-present: National Network for Bacterial Genomics (coordinator) Previous Positions

2003-2008: Senior researcher, Ramon y Cajal repatriation program, Miguel Hernandez Univ. Postdoctoral Research

2002-2003: Postdoctoral Research Fellow (Swedish Research Council) in Bacterial Genomics, laboratory of Prof. Siv G. Andersson, University of Uppsala, Sweden

2001-2002: Postdoctoral Research Fellow in Bacterial Genomics & Bioinformatics, laboratory of Prof. Howard Ochman, University of Arizona, USA

1999-2001: Postdoctoral Research Fellow in Bacterial Genomics, laboratory of Prof. Nancy Moran, University of Arizona, USA

Educación

-PhD. Dep. of Zoology, University of Oxford, UK, 1999. Thesis advisor: Prof. Steve J. Simpson

-MSc. Dep. of Zoology, University of Oxford, UK, 1995. Honour distinction. Thesis advisor: Dr David Raubenheimer and Prof. William D. Hamilton

-B.Sc. Biology, University of Alicante, 1994 (Best student award, 1991-1994 class)

Proyectos Nacionales y Internacionales

-MICINN (Ministry of Science and Innovation, Spain – CONSOLIDER Program) “Microbial Comparative Genomics-MICROGEN” Role: PI. 285,000 €

-MECO (Ministry of Economy and Competitiveness, Spain) “New strategies against dental caries”. Role: PI. 110,000 €

-FECYT (Spanish Foundation of Science and Technology) “Development of a new anti-caries products”. Role: PI. 240,000 €

-MECO (Ministry of Economy and Competitiveness, Spain) “Search for new antimicrobial peptides in the human genome”. Role: PI. 45,000 € Completed

-MICINN (Ministry of Science and Innovation, Spain) “Population metagenomics of human microbial communities: experimental and computational aspects” Role: PI

-MICINN (Ministry of Science and Innovation, Spain). “2D Metagenomics:An alternative to cloning for studying bacterial diversity” Role: PI

-MICINN (Ministry of Science and Innovation, INNOCASH Program for creation of technology- based companies). “Metagenomics of Caries”. Role: PI

-Ministry of Health (Spain). “Comparative Genomics of Oral Bacteria” Role: PI -Ministry of Science and Technology (Integrated Actions Spain-France). “Metagenomics of the deep Mediterranean bacterioplankton”. Role: PI.

-Genome Spain (Ministry of Science and Innovation, Spain). “Creation and maintenance of the Spanish Network for Bacterial Genomics”. Role: PI

-CONACYT (Mexican Res. Council) “Metagenomics of birds microbiota”. Role: Coll.

-Tauli Foundation and Catalonian Institute of Neumology “Metagenomic study of the microbial diversity in the respiratory tract”. Role: Coll.

Premios y reconocimientos

-British Council post-graduate scholarship (1994)

-St Hugh’s College MSc Award, Oxford University (1995)

-Rhodes scholarship, Oxford University (1995-1998)

-Fulbright scholarship for research in the USA (1999-2000)

-Ramon y Cajal Fellowship, Spain (2003-2008)

-FUNDEUN Award for Innovation, University-Enterprise Foundation (2007)

-Ministry of Science. Certification of Outstanding Research Trajectory, (I3 Program), 2008.

-Jaime Ferran National Award for Microbiology, Spanish Society for Microbiology 2009

-Biomedal award for research in microbiology, Spanish Society for Microbiology 2012

Selected Publications (without PhD advisor). H-Index: 22, Citations: 2050.

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